מס הכנסה הוא מס שמשולם על ידי עצמאים מרגע שפתחו עסק ופתחו תיק במס הכנסה ובביטוח הלאומי. בעת פתיחת העסק הטיל פקיד השומה שיעור מס אותו גזר מביצוע הערכה משוערת של ההכנסות הצפויות. את המס הזה משלמים העצמאיים באמצעות פנקס שמיועד לכך.
אפשרות נוספת לתשלום המס שקבע פקיד השומה, זה על ידי ניכוי מס המנוכה מהחשבוניות שמוציא בעל העסק העצמאי ללקוחות שלו ונקרא ניקוי מס במקור. לאחר סיומה של שנת המס, העצמאי מחויב להגיש דו"ח לרשויות המס ובו הוא מדווח ומפרט את ההכנסות השנתיות שלו ואת הוצאותיו. את הדו"ח השנתי מגישים בדרך כלל עד חודש מאי של שנת המס הבאה. לעצמאיים כדאי מאד להכיר את כל ההקלות וההטבות הקשורות במס וניתנות על ידי המדינה לתושביה, מאחר ורישום הכנסות והוצאות, הצהרה עדכנית על מצב אישי ומצב משפחתי ועוד יתרמו לתשלום של מס מדויק יותר, נכון יותר ולא פעם מופחת מהמוערך.
לאחר הגשת הדו"ח ובהתאם למדווח בו, בודק פקיד השומה האם קיים פער בין המס ששולם לבין המס שצריך לשלם בפועל, שכן המס ששולם הוא על פי הערכת הכנסות. כאן נכנס לתמונה נושא החזר מס לעצמאים. אם שילם העצמאי מס גבוהה יותר משיעור המס שקבע לו פקיד השומה עם הקמת העסק או בשנת המס האחרונה הקודמת, יהיה העצמאי זכאי להחזר מס.
פקודת מס הכנסה סעיף 159א עוסקת בנושא של החזר תשלום מס יתר בעקבות הגשתו של הדו"ח השנתי, סעיף קטן (ב) אף קובע שבמידה והעצמאי שילם בשנת המס המדווחת יותר מאשר הסכום אותו היה צריך לשלם, ואין זה משנה אם שולם באמצעות ניכוי במקור או באמצעות פנקסי השוברים, דו"ח שהוגש על פי סעיף 131 ואשר התבסס על מסמכים רלוונטיים או פנקסי חשבונות, הוא יהיה זכאי להחזר מס בסוף חודש יולי שבשנת המס הבאה או בתוך 90 יום מרגע שהגיש את הדו"ח, לפי המאוחר מבין השניים.
ועל אף הגשתו של הדו"ח השנתי בצורה מדויקת ביותר, ולמרות הדיווח השוטף שמדווח העצמאי, קיימים בכל זאת כמה מצבים בגינם יהיה העצמאי זכאי לקבל החזר מס. למשל אם אותו עצמאי סגר את העסק במהלך שנת מס והפך מעצמאי לשכיר, אם פספס חלק מההוצאות ולא כלל אותן בדו"ח מאי ידיעה או אף בגלל חוסר תשומת לב או היסח דעת. עצמאי יכול לקבל החזרי מס גם במקרים של הכנסות חד פעמיות או הכנסה ממספר מקורות הכנסה בעת ובעונה אחת.
לסיכום, קיימים לא מעט עצמאיים שזכאים לקבל החזרי מס מהמדינה ובדיקה עקבית של הדו"ח השנתי והקפדה על דיוק רב בו, יכולה להביא לכך שאותם עצמאים יזכו לקבל בחזרה כספים מרשות המיסים. בכדי לקבל החזרי מס על זה ששולם, כל מה שצריך זה פשוט או לתקן את הדו"ח השנתי שהוגש או להגיש למס הכנסה בקשה להחזרי מס.